发票与付款金额不一致如何抵扣?

今天考了法律，好难，都是案例分析题，一个公司与8个村民签了合同，后面他们不让这个公司好好经营，公司把他们告了，然后他们8人反诉，问他告他们，他们告他是什么普通诉讼共同诉讼啥的【表情】【表情】【表情】

一个核心原则：
国家优先鼓励 “硬核”技术输出 和 实体运输 适用零税率。
一个记忆口诀：
“研、设、运，走出去，税率是零真优惠；
其他服务也出海，只能免税不退税。”
解释：
“研”（研发）、“设”（设计）、“运”（运输，包括航天运输服务），这些适用零税率。
“其他服务”，比如题目中的知识产权服务，以及电信服务、鉴证咨询服务等，虽然向境外提供也免税，但不能享受零税率。

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一、注会的题目：【例题·计算题】2024年9月1日，甲食品厂（一般纳税人）购进某农场自产小麦一批，用于生产饼干，收购凭证注明价款为78 680元，从某供销社（一般纳税人）购进小麦一批（用于生产面粉），增值税专用发票上注明销售额400 000元。
要求：计算甲食品厂进项税额及采购成本。
【答案】
进项税额＝78 680×10%+400 000×9%＝43 868（元）
采购成本＝78 680×（1-10%）+400 000＝470 812（元）


二、税法的题目：【例题·综合题】（2023年）造纸厂为增值税一般纳税人，纳税信用等级为A级，主营业务为销售办公用纸制品，2023年3月份业务如下：
（1）从某商贸公司（一般纳税人）处购入原木一批，增值税专用发票注明金额500万元，税额45万元；从某木材批发商（小规模纳税人）处购买原木一批，取得增值税专用发票注明金额150万元，税额4.5万元；从棉农手中购买棉花，价款20万元，开具农产品收购发票。款项当月已全部支付。前述原材料，生产车间已领用加工生产纸浆。
根据上述资料，回答下列问题。
（1）业务（1）可抵扣进项税额为（ ）万元。
A.59.8
B.67
C.60.3
D.51.3
【答案】B
【解析】可以抵扣的进项税额＝45＋500×1%＋150×10%＋20×10%＝67（万元）。

发现一个问题：注会题目的答案来看，计算抵扣得看取得发票是否来自农产品源头，所以从供销社环节取得得的不得计算抵扣；但看税务师这个题目的答案，好像从批发这个环节（题目好像也没说是源头）取得农产品也是可以计算抵扣的。这两个题目让我有点蒙~有人可以帮忙解答一下吗？