政府通过招标定制开发某软件系统，政府支付交易对价，获得软件产权，是互惠交易，软件开发公司应根据《收入》准则确认收入和成本，选项A正确，选项B错误;如果政府行文单方面资助该企业或该类企业用于开发某类软件、产权归属某企业或某类企业所有的，是无偿的行为，应根据《政府补助》准则在收到款项时确认为递延收益，自该软件可供使用时起，逐期计入以后各期的收益，选项C正确，选项B错误。