该小规模纳税人月销售额超过10万元，当月全部销售额均不免征增值税。其中，税务机关代开的3%的增值税专用发票部分，按照3%计算缴纳增值税；未开具发票和开具普通发票部分减按1%征收增值税。应纳增值税=50000×3%+（100000+20000）/（1+1%）×1%=2688.12（元）。