这是一道关于非货币性资产交换中换入资产入账价值确定的题目，解题关键在于理解具有商业实质的非货币性资产交换中，换入资产入账价值的计算方式，要考虑换出资产公允价值、相关税费以及支付的补价等因素 。

分析题目条件

• 甲、乙公司均为增值税一般纳税人，转让无形资产增值税税率6% 。

• 甲公司以其他权益工具投资（丙公司股票）交换乙公司专利技术，交换具有商业实质 。

• 甲公司其他权益工具投资交换日公允价值550万元（免征增值税）；乙公司专利技术交换日公允价值和计税价格550万元，账面价值520万元 。

• 甲公司另向乙公司支付价款33万元 。

具体计算过程

在具有商业实质且换入资产或换出资产的公允价值能够可靠计量的非货币性资产交换中，换入资产的入账价值 = 换出资产的公允价值 + 支付的补价（或 - 收到的补价） + 应支付的相关税费（本题中涉及的增值税需分析）。
乙公司专利技术是无形资产，转让时增值税销项税额 = 550×6% = 33（万元） 。甲公司支付的33万元价款，其实就是用于支付乙公司专利技术的增值税销项税额 。
换入专利技术的入账价值以换出资产（其他权益工具投资）的公允价值550万元为准，因为该项交换具有商业实质，且换出资产公允价值能可靠计量，所以甲公司换入专利技术的入账价值为550万元 。

综上，答案选B，是根据非货币性资产交换中换入资产入账价值的确定规则，结合本题中公允价值、增值税等因素得出的，换入专利技术入账价值为换出股票的公允价值550万元 。