（1）选项A：视同发生应税交易，应计算缴纳增值税；（2）选项B：既不属于应税交易，也不属于视同发生应税交易，不缴纳增值税；（3）选项C：不涉及有偿转让行为，不缴纳增值税；（4）选项D：由于自然资源所在地在境内，属于在境内转让自然资源使用权，应当计算缴纳增值税。