你好，想咨询全资子公司注销，子公司与母公司有往来未清，还有未分配利润，子公司与母公司的账务应该怎么处理？

不知你们是什么性质的企业，国企、民企处理有差别的，主要是国企有划拨一说，而民企没有。
假定你们是民企吧。
这种情况属于转让，双方签署资产转让协议，协议中规定标的（拟转让的资产等）、价格、支付方式等。
企业转让资产，该项资产的净值，准予在计算应纳税所得额时扣除。
应纳税所得税 = （收入全额 - 财产净值）*税率  （多数企业为25%）

转让财产所得税是转让方（子公司）缴纳的，受让方（总公司）不用缴纳。

总公司账务处理比较复杂，如果是全资子公司，应该使用权益法合并，同时冲抵两个公司之间的应合并项目。
借：银行存款
       存货 
       无形资产—土地
       固定资产—厂房
       固定资产—设备
       。。。

       贷：应付账款   
              其他负债  
              长期股权投资—子公司 

这个一句两句可说不清楚。